Искусственный интеллект Claude Opus 4.8 самостоятельно проектирует белковые связывающие молекулы с высоким уровнем успешности

Исследователи из Anthropic продемонстрировали способность ИИ-моделей Claude Opus 4.8 и Mythos Preview полностью автономно проводить кампании по дизайну белковых связывающих молекул (биндеров). Используя единую протокольную инструкцию и открытые инструменты для проектирования и предсказания структуры белков, ИИ самостоятельно выбирал мишени, эпитопы, запускал необходимые модели и оптимизировал кандидатов, не требуя вмешательства человека.

В рамках эксперимента были проведены кампании против 16 различных белковых целей, по итогам которых синтезировали и протестировали 1 320 вариантов. Результаты показали, что 354 дизайна (27%) проявили связывание, а среди лучших по ранжированию — почти половина (49%) оказались активными. Для сравнения, в недавно проведённом открытом конкурсе по дизайну для субъединицы E3 лигазы RBX1 из 245 вариантов связали только 9, тогда как у Claude Opus 4.8 из 90 дизайнов связали 28, при этом наилучшее связывание по константе диссоциации (KD) составило 3.9 нМ против 45 нМ у победителя конкурса.

Интересно, что несмотря на то, что кросс-видовая реактивность не была приоритетом, 130 из 233 протестированных биндеров также связывали мышиный ортолог их мишени. Все используемые модели — с открытым исходным кодом, что делает технологию доступной для широкого научного сообщества.

Авторы опубликовали полный набор протоколов, модели для всех 1 440 разработанных вариантов и экспериментальные данные для 1 320 с достоверными измерениями, что создаёт репродуцируемый стандарт и эталонный датасет для автономного дизайна белковых биндеров.

Данная работа демонстрирует значительный шаг вперёд в применении ИИ для биомолекулярного инженерного дизайна, снижая зависимость от человеческого эксперта и ускоряя процесс создания потенциальных терапевтических и диагностических молекул.

По данным Hyper.ai.